提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
台湾货币政策主管机构决定加息0.125个百分点******
中新社台北12月15日电 台湾货币政策主管机构15日决定上调政策利率0.125个百分点,该机构负责人表示,这次货币政策调整基调为“温和紧缩”,并暗示2023年第一季度仍有加息可能。
综合中央社、联合新闻网报道,台湾货币政策主管机构当日召开会议决定加息,重贴现率、担保放款融通利率以及短期融通利率分别由年息1.625%、2%、3.875%,调整为1.75%、2.125%、4%,自12月16日起实施。该机构同时下调2022年台湾经济增长率至2.91%,2023年经济增长率则下调至2.53%,预估2023年当地消费者物价指数(CPI)及核心CPI分别同比增长1.88%及1.87%。
上述机构负责人表示,货币政策取决于经济数据,货币政策主管机构必须确保通货膨胀率在2%以下,该机构预测,2023年第一季度CPI及核心CPI增长率分别为2.35%和2.44%,第二季度才会降至1.64%和1.93%。这暗示2023年第一季度仍存在加息可能。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |